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河北省治疗前人群耐药毒株分子传播网络研究(2)
作者:网站采编关键词:
摘要：0.05)。 2.4HIV-1分子传播网络 利用TN93模型计算276条pol基因序列基因距离，在0.5%～2.0%的基因距离间，1.5%基因距离阈值下，传播簇分辨率高且分子网络中能区
<0.05)是HIV-1发生耐药突变的显著性影响因素。18～29岁处于性活跃期的青年耐药发生率最高，达到8.16%，其次是50岁以上的老年人(6.98%)；作为河北省主要的3种流行毒株，CRF01_AE亚型耐药率为8.03%(11/137)，CRF07_BC亚型耐药率为2.44%(2/82)，B亚型耐药率为3.70%(1/27)。而其他变量对耐药突变的影响无统计学意义(P>0.05)。
2.4HIV-1分子传播网络 利用TN93模型计算276条pol基因序列基因距离，在0.5%～2.0%的基因距离间，1.5%基因距离阈值下，传播簇分辨率高且分子网络中能区别的传播簇最多，在此阈值下，构建HIV-1分子网络图，共有95条序列入网，入网率为34.4%(95/276)，共鉴别出30个传播簇，其中≥3个节点的传播簇共有9个。CRF07_BC序列在网络中构成比最高，包括9个传播簇，其中1个传播簇包含27个节点，是网络内最大的传播簇，传播风险较高；CRF01_AE序列在网络中共包含16个传播簇，其中发现K103R/V179D耐药突变毒株在沧州地区同性性行为人群构成的三节点传播簇中传播，造成对EFV/NVP中度耐药，RPV低度耐药；M46I耐药突变毒株在张家口地区同性性行为人群构成的两节点传播簇中传播； URF_01B序列在网络中包括2个传播簇(7例)，该传播簇携带V106I潜在耐药突变，在保定、沧州地区同性及异性性行为人群构成的五节点传播簇中传播，在石家庄地区同性性行为人群构成的二节点传播簇中传播；B亚型序列在网络中形成1个三节点传播簇，同样携带V106I潜在耐药突变位点。详见图1与表3。
图1 抗病毒治疗前HIV-1分子传播网络图Fig.1 HIV-1 molecular transmission network before antiviral therapy
2.5URF_01B重组亚型鉴定 利用邻接法构建N-J系统进化树(图2)，共检出8例(2.90%) URF_01B重组亚型。8例URF_01B与石家庄地区2015年、2018年报道[6-7]的CRF01_AE/B重组亚型独立聚集成簇，校验值为100%，初步判定这8例URFs为CRF01_AE/B重组亚型，通过HIV Database在线RIP 3.0软件对8例URFs的基因序列进行镶嵌结构分析，确定其为CRF01_AE和B亚型重组体。
表2 抗病毒治疗前HIV-1耐药影响因素分析Tab.2 Factors influencing HIV-1 drug resistance before antiviral therapyFactorsCasesN(%)Univariate analysisMultivariate analysisOR (95%CI)PaOR(95%CI)PTotal(6.16)Gender Male(5.57) Female162(12.50)2.33()() Han(6.34) Unmarried1116(5.41) Married1328(6.06)1.13()()/widowed333(9.09)1.75()() route Homosexual(5.31) Heterosexual584(6.90)1.32()()(18.18)3.96()()0.477Age 18～988(8.16) 30～754(5.33)0.63()()0.137 40～602(3.33)0.39()()0.025 50～433(6.98)0.84()() level Middle school(6.90) Elementary school191(5.26)0.75()() degree or above804(5.00)0.71()() CRF01_AE(8.03) CRF07_BC822(2.44)0.29()()0.029 B271(3.70)0.44()()0.244 Othersa303(10.00)1.27()():a，CRF08_BC、CRF55_01B、CRF68_01B、CRF65_cpx、CRF80_0107, and URFs (unique recombinant forms).
表3 抗病毒治疗前HIV-1分子网络中耐药株情况Tab.3 Information of HIV-1 resistant strains circulating in the molecular network before antiviral routeNNRTIPICRF01_AEHE18S0128CZMale31Divorced/widowedMSMV179DHE18S0360CZMale21UnmarriedMSMV179DHE18S0121CZMale20UnmarriedMSMV179DHE18S0229ZJKMale22UnmarriedMSMM46IHE18S0231ZJKMale30UnmarriedMSMM46I表3(续) routeNNRTIPIBHE18S0291BDMale31UnmarriedMSMV106IHE18S0296BDMale56MarriedMSMV106IHE18S0301BDMale49MarriedMSMV106IURF_01BHE18S0090XTMale52MarriedHeterosexualV106IHE18S0129CZMale45MarriedHeterosexualV106IHE18S0284BDMale26UnmarriedMSMV106IHE18S0290BDMale18UnmarriedMSMV106IHE18S0298BDMale25UnmarriedMSMV106IHE18S0299BDMale25UnmarriedMSMV106IHE18S0322SJZMale25UnmarriedMSMV106IHE18S0353SJZMale31MarriedMSMV106IV106I will lead to potential resistance; CZ, Cangzhou; BD, Baoding; SJZ, Shijiazhuang; ZJK, Zhangjiakou; XT, Xingtai; MSM, men who have sex with man.
Black dot(●) denotes HIV-1 URF_01B； Black triangle(▲) denotes reference sequences图2 8例URF_01B重组毒株pol区序列Neighbor-Joining进化树分析Fig.2 Phylogenetic tree analysis based on HIV-1polgene sequences from URF_01B strains
3 讨 论
本研究结果显示CRF01_AE、CRF07_BC和B亚型是目前河北省前3个主要HIV-1流行毒株，与河北省邻近地区北京和天津市的HIV-1流行毒株流行形式基本一致[4-5]。8例URF_01B与石家庄地区2015年、2018年报道[6-7]的CRF01_AE/B重组亚型独立聚集成簇，在1.5%基因距离阈值下，7例URF_01B序列入网，这7例感染者分布在河北省中部及南部地区的石家庄、保定、沧州的同性传播及异性传播人群中，表明该重组亚型已通过性传播方式发生跨地区传播，且传播关系相对较近。而且，7例URF_01B患者均携带V106I潜在耐药突变位点。
同时证明抗病毒治疗前HIV-1耐药突变发生率为6.16%，低于北京市[4]、河南省[8]等临近省市，与全国耐药数据平均水平基本持平[9]。其中有3例产生高度耐药，10例产生中度耐药，4例产生低度耐药。NNRTI类耐药率最高为4.35%，主要耐药突变为K103R/V179D，对依非韦伦(EFV)、奈韦拉平(NVP)中度耐药，对利匹韦林(RPV)低度耐药；NRTI类耐药率为0.36%，出现耐药的位点为L74I，对阿巴卡韦(ABC)中度耐药、去羟基苷(DDI)高度耐药；PI类耐药率为1.09%，耐药突变为M16I/L，对奈非那韦(NFV)产生耐药；NNRTI及PI类药物的双重耐药率为0.36%，尚未发现三重耐药HIV-1感染者。
文章来源：《河北科技图苑》 网址: http://www.hbkjty.cn/qikandaodu/2021/0328/633.html